Osada Rakitnica pojawia się w dokumentach już w 1311 roku, a dzisiaj widoczne są jeszcze pozostałości niegdysiejszych domów i murów obronnych budowanych techniką suhozidu.
Lokalny kościół św. Jana Chrzciciela, który znajduje się w pobliżu wioski, zbudowany został w 1445 roku, kiedy to została też założona parafia.
Šibeniccy szlachcice, właściciele Rakitnicy, razem z mieszkańcami wioski rozpoczęli w 1509 roku budowę twierdzy Gradina na stromym grzebieniu nad wioską, a wszystko po to, by móc się obronić przed Turkami. Przez cały XVII wiek prowadzone były zażarte walki między wojskiem tureckim i wenecjańskim o Rakitnicę, ale pokój nastąpił dopiero po 1699 roku, kiedy to Turkowie opuścili ten region.